草鱼鱼苗在养殖过程中容易受到多种疾病的侵袭，做好疾病防治工作至关重要。常见的疾病有烂鳃病、肠炎病和赤皮病等。烂鳃病主要由感染引起，患病鱼苗的鳃丝腐烂、粘液增多，严重时会导致呼吸困难。防治方法是定期用二氧化氯等剂对池塘进行，保持水质清洁；一旦发现病鱼，可用恩诺沙星等拌饵投喂。肠炎病多由投喂变质饲料或水质恶化引起，鱼苗会出现腹部膨大、肛门、肠道充血等症状。预防肠炎病要保证饲料新鲜，定期投喂大蒜素等免疫增强剂；时可使用氟苯尼考等。赤皮病通常因鱼体受伤后感染所致，病鱼体表充血、鳞片脱落。防治措施包括在拉网、运输等操作时避免鱼体受伤，发病后用聚维酮碘溶液全池泼洒。此外，还可定期在饲料中添加维生素 C、维生素 E 等，增强鱼苗的。